Het Junior Studiehuis kent in totaal drie projecten. De leerlingen van de derde klas nemen, waar dat mogelijk is, zelf de organisatie van deze dagen op zich, maar worden daar natuurlijk wel in begeleid.

1e klas: (augustus: kennismakingskamp) (januari en mei: project)
2e klas: (januari en mei: project) (juni: proefwerkweek)
3e klas: (januari: profielkeuzeproject) (mei: filmproject/3 dagen kampafsluiting Junior-studiehuis)
1e, 2e, 3e klas (november: afternoon tea)

Zowel in de brugklas als in de tweede klas doen leerlingen mee aan de bestaande projecten die aan het eind van de derde periode voor alle brug- en tweede klassen worden gehouden. De organisatie eindejaarsexcursie ligt deels in handen van de leerlingen. De school biedt het kader waarbinnen dit wordt georganiseerd:

• leerlingen maken in overleg met de mentor een plan
• leerlingen maken afspraken over verblijf en vervoer
• leerlingen organiseren dagelijks een ochtend-, een middag- en een avondprogramma
• het programma bevat minimaal twee educatieve activiteiten
• de leerlingen stellen een begroting op