Uitgangspunt in het Junior Studiehuis is dat er zelfstandig gewerkt wordt. Omdat leerlingen veel kunnen leren van samenwerken, is het vaak toegestaan om in tweetallen te werken en soms ook in grotere groepen. De docent begeleidt dit samenwerkingsproces. Bij samenwerken behoort een bepaalde mate van ‘ruis’. Dit noemen we de “fluistercultuur”. Wanneer een leerling te luid overlegt en dus een ander stoort, heeft de leerling een grens overschreden en wordt hij/zij hierop aangesproken.