De derde klas Vwo/Havo is een soort tussenjaar. De basisvorming is voor een groot aantal vakken afgerond en de Tweede Fase start pas in het vierde leerjaar. In de derde klas moet daarvoor een fundament gelegd worden. Pedagogisch hoort klas 3 nog bij de basisvorming, maar didactisch is er meer aansluiting bij de zogenaamde Tweede Fase (Vwo 4 t/m 6 en Havo 4 en 5). Vanwege de sociale groepsvorming is in het begin van het schooljaar een activiteit opgenomen die juist dat aspect benadrukt.

Elke klas heeft een eigen mentor, die deel uitmaakt van een mentorenteam. De mentor verzorgt in de derde klas een mentorles. In die les ligt de nadruk op de begeleiding en de beroepsoriëntatie in verband met de keuzes voor klas 4.

Vooral het laatste punt is belangrijk, aan het eind van de derde klas moeten de leerlingen de keuze voor een bepaald profiel in de bovenbouw maken. Zowel voor Vwo als Havo betekent dat een keuze tussen de volgende profielen: Cultuur & Maatschappij (CM), Economie & Maatschappij (EM), Natuur & Gezondheid (NG) of Natuur & Techniek (NT).

Om tot een goede keuze voor de leerlingen te komen wordt in de eerste en tweede lesperiode in de mentorlessen aandacht besteed aan de profielen en vakken van de Tweede Fase. Aan het einde van de tweede periode van het schooljaar vindt dan een project “Profielkeuze” plaats: de leerlingen gaan naar aanleiding van een gekozen profiel in groepjes dit profiel nader uitwerken en aan hun klasgenoten presenteren.
In de week vóór de meivakantie vindt er een inhoudelijke verdieping plaats door middel van uitdagende opdrachten met een “tweede fase aanpak”. Zo ervaren de derdeklassers een aspect van de vierde klas.

Op het derde rapport verschijnt de voorlopige profielkeuze en het advies van de vakdocenten. Samen met het rapportcijfer, de adviezen en de voorlopige profielkeuze wordt tijdens de vierde periode de definitieve profielkeuze gemaakt.

Leerlingen die onvoldoende staan voor een vak kunnen in de zogenaamde I-uren extra les krijgen (met uitzondering van de leerlingen in klas 3 Junior Studiehuis). Het aanbod van I-uren in bepaalde vakken is afhankelijk van de beschikbaarheid van de vakdocenten. De I-uren beginnen in de tweede periode. Per periode wordt bekend gemaakt welke leerling ingedeeld wordt bij welk I-uur.